从整体上看，当前农民专业合作社的发展虽然较快，发育却非常缓慢，尚处于起步阶段。大多规模较小，稳定性较差，服务功能低层次。农民专业合作社作用难以最大化的原因很多。

　　一是各自为政的体制，难以形成合力。我国“三农”管理体制基本沿袭了计划经济的条块分割，农村经济发展被划分为农业、畜牧、水产、农机、水利等10多个系统，对“三农”的管理指导个个有责，人人管得着，但部门分割、各自为政、难以形成合力。农民专业合作社，地方农办和供销合作社虽都有指导职责，但体制决定了双方各行其事。

　　二是缺乏信贷支持和风险保障机制。农民专业合作社是一个弱势群体的组织，虽然《农民专业合作社法》从法律上确立了其法人主体地位，但因其自身的弱小，没有资金积累，也无资产可抵，得不到信贷的有效支持。据统计，中国正规金融机构对农民贷款的覆盖率只有20%，贷的也只是一些小额贷款（通常在3000-5000元间），只能满足农民简单再生产的信贷需求；涉农部门对专业合作社的扶持资金非常有限。在我国农业是个弱质产业，自身的弱质性和生产过程的特殊性，使其面临着许多风险，专业合作社把生产与经营集中，风险也就相对集中，加之农民的风险防范意识又薄弱，农业保险至今没有有效突破。

　　三是缺乏发展特色农业的产业规划。一些干部对发展专业合作社的重要性认识不足，对专业合作社在农业增效、农民增收中的作用、地位看法不一，有的部门或乡镇在引导、发展专业合作社时，没有正确把握“民办、民管、民受益”的原则，干预过度，更不要说整体的发展思路。以至没有象样的农业产业规划,或者是严重缺乏“一乡一品、一村一品”的强调，对农民专业合作社的服务也是严重缺位浮在面上，更不要说实施“一乡一品、一村一品”的引导，基本上任其自生自灭，停留在做表面文章。

　　四是优惠政策往往“肠梗阻”。为鼓励专业合作社的发展，各级政府虽然出台了扶持政策，但落实起来往往犯“肠梗阻”。从调查情况看，缺乏可操作性、缺乏协调机制、地区部门利益干扰、土地流转缺乏灵活等，直接影响着政策效能的发挥。如专业合作社在注册登记、执照变更时烦，多的要跑十几趟，少的四、五趟，实属不易。“绿色通道”不畅通，本地区“绿色通道”能通，跨地区时难以畅通无阻。（易 名）