实现有机和无机肥料资源的合理配置和高效利用，才有可能实现作物优质高产和保护生态环境的双赢目标。
目前，我国肥料资源及其利用现状很严峻。众所周知，氮肥生产的问题实际上是能源问题，以煤为原料的企业生产1吨尿素，约需要消耗1.2吨煤和1200千瓦时电力。当今世界能源紧缺是最为严重的世界性问题，我国能源问题更加突出，我国人均煤炭、石油、天然气资源量仅为世界平均水平的60%、10%和5%，但是，我国能源消费总量已经位居世界第二。磷肥和钾肥资源又是不可再生的重要矿产资源，我国磷肥资源有限，而且大部分分布在大西南，运输不便，而钾肥资源十分贫乏，钾肥主要靠进口。
长期以来，我国依靠化肥的大量投入提高作物产量，形成了特有的化肥高量投入和农田高强度利用的生产体系。2005年，我国化肥消费量达到4766万吨，占世界化肥消费总量的32％，但是，肥料利用效率低，氮素当季回收率仅有30％，比发达国家低15－20个百分点。大量的有机养分资源未能充分利用。据估计，我国农业生产系统内部生成的有机养分每年高达5300多万吨，但是有效返回农田的仅有三分之一左右。集约化农区氮磷肥过量施用以及有机肥资源浪费导致生态环境恶化，加重了环境和水体污染。
因此，我国农业，尤其是种植业，面临着资源紧缺和环境质量下降的双重挑战。一方面，满足13亿人口和国民经济高速发展的需求，必须利用有限的耕地生产尽可能多的粮棉油和其他农产品，这就需要加大投入，包括增加肥料的施用。但是，另一方面，我们又必须坚持生产发展、生活富裕、生态良好的文明发展道路，建设资源节约型、环境友好型社会。我国高投入、高产出、高度集约化的生产体系加大了保持良好的生态环境的难度。因此，必须加强研究，通过理论和技术上的创新，最大限度和科学利用所有可以利用的有机肥料资源，变废为宝，减轻其对环境的压力，最大限度地提高化肥的利用效率，降低损失率，提高施肥效益。通过建立科学的有机-无机肥料相结合的肥料管理和施用体系，实现有机和无机肥料资源的合理配置和高效利用，才有可能实现作物优质高产和保护生态环境的双赢目标。