主要问题及困难。一是对利率改革准备不足。利率改革最根本的条件是农信社是否具备自我约束、自负盈亏、自我发展的机制，是否成为一个成熟的市场主体，但从目前的现状来看，离改革的要求还有很大的差距。
二是利率风险管理能力较低。对利率风险的认知程度较低，相对于支付风险、信贷风险而言利率风险还是一个陌生的概念。目前，缺乏主动调整利率风险的金融产品和工具，在利率风险转嫁中处于被动地位。
三是资金定价能力不高。目前，还未形成完善的资金定价体系，确定利率水平还带有一定的主观盲目性，对利率的确定主要是依据社会资金供求状况、企业和农信社的赢利水平等经济指标，但上述指标有的难以精确测定，有的存在着一定的时滞效应，很容易产生信号失真的情况。
对策建议。首先完善产权约束和法人治理结构。要严格按照国务院关于农信社改革的统一部署进行改革，使其尽快成为“产权明晰、权责分明、决策民主、管理科学”的一个市场主体。要成立专门的利率管理机构，其主要职责是制定利率管理制度，建立利率风险指标监测体系，收集影响利率变化的各种信息，定期对利率的走势进行分析等。
其次建立完善的资金定价体系。一是要按照收益、风险成本对称的原则，按业务品种、部门、网点进行核算，并根据客户的信用风险、综合收益、筹资成本建立综合的测算体系，并将成本核算的结果用于确定不同的利率水平，使之能够根据利率变化进行理性的经济活动。二是要建立动态的利率风险监测体系。根据资产负债总额、结构、期限变动，以及社会平均利润变化和利率调整可能引起的风险，建立动态的利率风险监测体系，及时调整存贷款利率水平，并对存款、贷款利率水平和利差最低水平做出限制，将利率风险控制在事先规定的限度内。
第三实施业务多元化的发展战略。要把经营结构的调整提高到关系今后长远发展的战略高度，大力发展结算清算、银行卡、代收代付代理、保管箱、财务顾问、信息服务等中间业务，拓宽业务收入渠道，从业务结构上规避利率风险。