“十一五”开端之年的2006年，云南省烟草公司系统以科学发展观统揽全局，牢固树立和认真实践行业共同价值观，认真贯彻落实国家烟草局宏观调控的各项措施，烟叶生产继续保持平稳发展，卷烟销量和效益增长明显，专卖管理力度不断加大，体制改革有序推进，内部监管得到加强，市场秩序良好，进出口业务得到拓展，全系统经济运行继续保持了良好发展态势，效益水平再创历史新高。据统计，云南烟草全系统累计实现税利104.7亿元，其中实现税金42.05亿元，实现利润62.64亿元，分别比上年增长16.21%、7.89%和22.55%。“两烟”进出口工作取得较好成绩，出口烟叶104.6万担，同比增长9%，全年共创汇1.3亿美元，同比增长15.2%。
烟基建设成绩显著
按照国家烟草专卖局的统一部署，云南从建设社会主义新农村的高度出发，从2005年开始在该省各烟区开展以烟水工程和集约化烘烤为主的烟叶生产基础设施建设。在地方党委、政府的领导下，相关部门形成合力，统一组织、分工协作、齐抓共管，克服困难，本着对国家负责、对烟农负责、对行业负责的态度，责任落实到人、任务落实到乡村、资金落实到项目、管理落实到农户，烟叶生产基础设施建设取得了显著成绩。
2006年度云南省规划烟叶生产基础设施建设项目19.75万件，预计受益面积达178万亩，受益农户52.8万户，总投资约14.9亿元，其中烟草行业补贴资金10.66亿元。截至目前，已完成烟水工程项目18.2万件，占计划的98.6％，预计今年移栽前，烟水工程将全部完工并投入使用。
按照《云南省烤房建设工作的实施意见》的要求，该省以烤房改建五年规划为基础，重点对现有烤房进行密集化、自动化改造。全省共投入资金1.08亿元，规划建设新型烤房1.28万座，已完工投入使用的烤房8205座，其中新建密集烤房1956座，标准化烤房密集化改造634座、智能化改造5615座；可烤烟8.52万亩，受益农户1.79万户。新改建烤房规格高、质量好，既降低了劳动强度，又提高了烘烤质量，还节约了烘烤燃料。最近该省烟草公司按国家烟草局的要求，又与昆船等单位进行技术合作，进一步加大对烤房的研究试验，为今后推进集约化、专业化、市场化烘烤奠定基础。
全面落实好国家烟草局烟叶信息管理基础软件的推广，也是云南烟叶工作的一个重点。该省各级烟草部门成立了专门的组织机构，建立健全了考核制度，明确了推广原则、目标、进度要求及主要措施，按照“全面推广、一次到位、明确分工、责任到人”的要求，克服了点多面广、时间紧、任务重等诸多困难。通过各级各部门的辛勤努力，顺利完成了全省基础软件的推广任务。为今后云南所有产烟县和收购站点同时实现计算机化、网络化管理，最终实现从基层站点、复烤企业到国家局的烟叶管理信息全面联网奠定坚实的基础，也提升了云南烟叶工作管理水平。
烟叶生产持续健康发展
在烟叶生产上，为改善植烟土壤结构，提高土地综合利用率，不断提升云南烟叶生产的科技竞争力，云南对土地资源的概念越来越清晰。该省详细规划了约1300万亩基本烟田，可保证每年有600多万亩的土地种植烟叶及轮作。轮作是一项技术性较强且实用的耕作技术。通过轮作可以改善烟株生长环境，提高烟叶产质量，并对栽培制度与作物布局产生较大影响。烟草轮作给当地的作物布局带来了一系列的变化，逐渐形成了具有当地特色的作物种植结构。如云南玉溪等地的稻烟轮作布局，曲靖等地的麦烟轮作体系，不但有利于增产增收，而且还有利于保持和提高土壤肥力。
旱地和水田耕地面积的多少直接决定轮作的类型和方式。旱地较多，则以旱地轮作为主；水田较多，则实行水旱轮作。此外，作物种类多，其轮作的方式也相对比较复杂。根据生物多样性的原理：层次结构单一，生物多样性减少，生态功能差的烟田环境不能满足生态平衡的要求。因此，要求进行烟草和多种其他作物的合理轮作，利用生物多样性来保护烟田环境，从而提高烟叶产质量。国家烟草局批复了全省在5年内建设1088万亩基本烟田，目前建设项目正在按照规划逐年推进，将逐步满足和保证烟叶生产可持续发展所需的土地资源。
网建“整体推进”达标
网建“整体推进”工作通过国家烟草局考评验收，优质达标；支持和适应工业企业的品牌整合工作，品牌培育能力不断提高；科学组织货源，货源结构得到明显改善；云南省外低档卷烟的市场培育和销售取得突破性进展；市场基础得到提升，零售户获利水平普遍提高。
打假打私成绩斐然
云南保持打假打私高压态势，成绩斐然。2006年全省保持高压态势，在全省范围内开展了4次“风暴”打假打私专项行动。各级各部门认真落实打假打私责任制，坚持打源头与打网络并重，全省共破获制售假烟网络18个，其中代号为“0601”、“0602”特大网络案的破获使打网络工作取得重大突破。全年共出动打假打私人员24.1万人次，查办假冒卷烟案件6389起，各类走私涉烟案件1009起，查获假冒卷烟4.02万件，走私烟5620件，各种制假设备290台（套），刑拘566人，逮捕291人，判刑137人。