根据我国加入世贸组织(WTO)的承诺，2006年12月11日中国将对外资开放化肥批发零售市场。据悉，化肥流通体制改革也将于年内出台，加速化肥行业完全市场化进程。
目前，我国化肥价格仍实行政府指导定价，而国内化肥市场化程度已有较大提高，从总体情况来看，全面开放化肥价格由市场决定价格的条件已基本成熟。2005 年6月国家发改委提出了《改革和完善化肥价格调控机制的方案(征求意见稿)》，在政策、企业、协会等各方面的共同推动下，化肥流通体制改革取得了可喜的进展。
一、计划在今年年底取消对尿素的出厂限价，解除对化肥批零价差率控制和提价备案以及钾肥进口核准价格制度。
二、适时取消对化肥生产的优惠政策：
1.分三次取消对化肥生产的优惠电价；
2.取消对化肥铁路运价的优惠政策，但仍免缴铁路建设资金；
3.对能源价格实施改革，取消价格双轨制的同时，取消对化肥生产天然气的优惠价格；
4.对化肥出口税收政策保持不变，仍对尿素生产免征增值税。
三、化肥价格放开后，政府通过建立化肥淡季储备制度和利用进出口税收来调节市场供应，促进化肥供求总量平衡、稳定价格。
四、建立对农民直补制度。
五、加大政府投入，建立科学的施肥体系，减少不合理的化肥施用量，保护环境。
六、推进化肥流通体制改革，建立规范的化肥市场流通秩序。
根据发改委的分析，我国目前化肥行业在流通上还存在一些突出的问题：
一、许多流通企业，自身竞争力不强，需要在观念和思路上不断创新。
二、总体的流通环境较差，地方保护主义、不合理检查、人为限制等因素制约了化肥产品的正常流通。
三、流通企业整体的农化服务水平还有待提高。
四、许多企业对于年底的外资进入还没有做好思想准备。
随着化肥流通体制改革政策的顺利出台，化肥行业完全市场化即将来到，我国化肥流通行业在迎接更大竞争的同时，将走上更加稳健的市场化道路。