作为金融机构，案件防范始终是农信社的重要工作之一。但现实中农信社的案件防范工作却存在着很多困难。
现实困难
会出制度到位难。双人临柜，交叉复核在部分农信社流于形式，存在一人临柜，业务“一手清”，完全靠职工的自觉性来保证，操作缺乏严密性；业务章戳乱放，随意委托以信任代替制度，潜在安全隐患；账务核对存在内外不分，一手核对，主要是对行社往来、社内往来和单位存款未真正做到换人定期核对；转账业务、冲账、调账“一手清”，存在监督空白点。
凭证管理控制难。从库存及领用、登记、销号入手，其中对使用环节的核查相对较难。关键是会计销号是否及时、认真，已销号凭证是否完整，作废凭证是否按规定处理和登记，缺号凭证是否隐瞒不报，外勤领用凭证是否做到五日报账交验核对，有无流失现象。
内部管理落实难。信用社自律管理意识淡薄，执行制度缺乏持之以恒的自觉性，四双一分、交叉复核制度流于形式，表里不一，存在事后补章等现象；在查防案件上，信用社往往过分地依赖稽核，而忽略了信用社自身内控机制的监督管理作用；担当信用社内部管理工作的主要责任人存在“当老好人”的思想，其责任意识淡薄和角色意识模糊，对自身存在问题既不能直面正视，又不能一整到底。
信贷风险防范难。贷款“三查”制度流于形式，集体审批存在先贷后批、先放后补等手续逆程序操作；审贷分离制度执行不力，部分农信社为逃避县联社的监督，采取“化整为零”的手段，套取农户小额信用贷款用于非农产业；农户联保贷款难以全面推开，甚至存在贷款户相互担保问题；违规贷款时有发生，屡禁不止，少数农信社存在个人立据企业用钱等垒大户贷款；信贷道德风险是一种难以控制的潜意识风险，往往取决于信贷员是否具有良好的职业道德和过硬的业务素质；贷款外清外核工作难度大，只有通过外核才能发现是否存在收贷收息不报账、跨区域放款和冒名贷款等问题。
计算机制度执行难。计算机运行日志记载不祥尽、不及时，使一些重要事项在检查时找不到依据；会计主管授权不真实，如电脑抹账、修改账户信息、撤销更改密码等业务，存在一人掌管两个代号及密码现象，越权办理特殊授权业务；操作人员短时离开未退出计算机操作环境等，都有可能给心术不正之人提供作案的机会。
对 策
案件专项治理工作是一项系统的复杂的艰巨工程，应上下联动，综合治理，加大稽核检查力度，建立防范案件和控制风险的案件专项治理长效机制，采取以下防案和控案的主要对策。
建立健全各项规章制度，农信社梳理和修订规章制度汇编成册，人手一份，并落实在具体日常工作与行动中。
建立案件专项治理网络，层层签订责任状，一级抓一级，一级对一级负责。
实行会计主管人员异地轮岗，对在一个信用社连续任期3年以上的主办会计进行异社换岗交流。
实行稽核员换片，对一年以上的驻片稽核员全部进行了工作片轮换，实行一年一换制度。
实行主办会计委派制，工资待遇由联社发放，将主办会计从信用社中分离出来，切实履行监督管理职能，使其成为联社委派在信用社的二级稽核员。
规范操作流程，加大综合治理力度，进行定期与不定期跟踪检查，严防各类突发性事件与案件发生，严格落实问责制。