微生物肥料是一类含活性微生物制备而成的肥料。由于其应用在农业生产中能获得特定的肥料效应，所以成为农业生产用肥中重点发展的新型功能性肥料品种之一。

    中国环境学会固废处理专家委员会委员、中国植物营养与新型肥料专业委员会委员、山东临沂大学生物化工工程技术中心主任吕庆淮认为，功能性肥料是采用新材料、新技术、新工艺、新设备改变原有品种或剂型而创造的具有肥料性能，同时具有某一种或几种不同特性的新型肥料。其主要特点是能够提高肥料利用率、保证粮食安全、减少环境污染、满足作物生长的需要等。有些功能性肥料还具有改良土壤、杀虫和除草等功能。

    微生物肥料利用微生物的生命活动及其代谢产物的作用改善作物养分供应，向农作物提供营养元素、生长物质、调控其生长过程，其生产成本低、不污染环境、可消耗城市、农村废弃物，实现无害化、肥料化。吕庆淮表示，微生物肥料不仅具有肥料性能，还有其特殊性能，所以会成为国际上当前和今后一个时期新型肥料研究和开发的热点领域之一，代表新型肥料研究和发展的一个方向，因此，微生物肥料产业将成为可持续农业的一个重要方面。

    吕庆淮介绍说，目前生物肥料主要有根瘤菌肥料、固氮菌类肥料、解磷微生物肥料、硅酸盐细菌类肥料等四大类肥料。

    根瘤菌肥料是推广最早，效果显著的一种高效菌肥，它与豆科植物共生，通过浸染豆科作物的根系进行结瘤固氮。根瘤菌对生产条件要求较苛刻，稍疏忽污染杂菌，产品就难合格；它还有严格的互接种族，一种根瘤菌剂只能用于相应的豆科植物，用错无效，另外，结瘤竞争、菌株选育及应用条件等问题解决得也不够理想，所以此类肥料在我国的发展并不快。

    固氮菌类肥料是指能自由生活的固氮微生物或与禾本科植物联合共生固氮的微生物为菌种生产的固氮类肥料，与根瘤菌固氮有本质的区别，其固定的氮素是供自身需求，当满足自身需求时，体内氨的浓度能抑制固氮酶系统，使固氮停止。由于此类微生物当中的许多菌株在生长繁殖中产生多种植物激素类物质，且其在根际生长繁殖没有严格的特异性，尤其易于在甘蔗、玉米、高粱等作物根部生长繁殖，应用范围广泛，因此这类肥料在生产上应用较广。

    解磷微生物肥料，这类微生物在生长、繁殖和代谢过程中产生如乳酸、柠檬酸等有机酸和植酸酶类物质，是固定在土壤中的难溶性磷如磷酸铁、磷酸铝以及有机酸磷酸盐矿化成作物能吸收利用的可溶磷，供作物吸收利用。磷细菌在我国有较好应用前景，但由于解磷机理不十分明确，施入土壤后的活动和消长动态、解磷作用发挥的条件不十分了解，加上菌剂质量不能保证，因而应用受到很大限制。

    硅酸盐细菌类肥料其硅酸盐细菌是一种能在以硅铝酸钾或长石粉为唯一钾源的培养基生长的细菌，这种细菌有分解释放矿物钾的能力。但现在还不能充分肯定硅酸盐细菌具有分解含钾矿物而释放水溶性钾的能力，因此，硅酸盐细菌肥料的作用还需要进一步研究。此外还有菌根类肥料、固氮蓝藻类肥料、抗生菌类肥料、根际促生型细菌肥料、光合细菌肥料等，为了提高接种效果，常采用复混剂型。

    通过以上四大类微生物肥料可以看出，微生物肥料是活体肥料，它的作用主要靠它含有的大量有益微生物的生命活动来完成。只有当这些有益微生物处于旺盛的繁殖和新陈代谢的情况下，物质转化和有益代谢产物才能不断形成。因此，微生物肥料中有益微生物的种类、生命活动是否旺盛是其有效性的基础，而不像其他肥料是以氮、磷、钾等主要元素的形式和多少为基础。正因为微生物肥料是活制剂，所以其肥效与活菌数量、强度及周围环境条件密切相关，包括温度、水分、酸碱度、营养条件及原生活在土壤中土著微生物排斥作用都有一定影响。

    吕庆淮认为，需加强微生物肥料的基础和应用基础研究，应当重点突破菌种构建技术、菌株组合技术，在载体、剂型、发酵工艺、设备方面取得拥有自主知识产权的关键技术；拓宽产品领域，研制一批新型微生物肥料产品；加强质量标准和检测技术研究，形成微生物肥料先进、快速、准确的质检技术体系，使我国微生物肥料产业健康发展。